İlk olarak 1940’larda çocuk felcini izlemek için kullanılan atık su gözetimi, o kadar güçlü bir hastalık izleme aracı olduğunu kanıtladı ki ABD Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri (CDC), Eylül 2020’de SARS-CoV-2 izlemesini desteklemek için Ulusal Atık Su Gözetim Sistemini kurdu. Şimdi, Penn State ve Pensilvanya Sağlık Bakanlığı’ndan bir bilim insanları ekibi, evsel kanalizasyon izlemenin gıda kaynaklı bir patojen için de yararlı olduğunu gösterdi.
Atık su takibi ile hastalık tespiti
Pensilvanya Sağlık Bakanlığı baş epidemiyoloğu ve Tarım Bilimleri Fakültesi’ndeki Penn State Gıda Bilimi Bölümü’nde bağlı araştırmacı olan Nkuchia M’ikanatha: “Tifo dışı Salmonella, dünya çapında gastroenteritin yaygın bir nedenidir, ancak hastalık için mevcut gözetim yetersizdir, bu nedenle bu araştırmada, bu gıda kaynaklı patojen için gözetimi artırmak amacıyla atık su izlemenin faydasını değerlendirdik. Bu çalışmada, atık su izlemeyi, bu gıda kaynaklı patojen için gözetimi artırmak amacıyla bir araç olarak inceledik. Atık su testi, bir toplumda dolaşan bulaşıcı hastalıkların izlerini, asemptomatik bireylerde bile tespit edebilir ve olası salgınlar için erken uyarı sistemi sunabilir” dedi.
Sağlık hizmeti sağlayıcılarının salmonelloz vakalarını bildirmeleri gerekirken, birçoğu tespit edilemiyor. Hayvanların ve insanların bağırsaklarında yaşayan salmonella bakterileri dışkıyla atılıyor. CDC, Salmonella’nın ABD’de her yıl yaklaşık 1,35 milyon enfeksiyona, 26.500 hastaneye yatışa ve 420 ölüme neden olduğunu tahmin ediyor.
Haziran 2022’de araştırmacılar, Pensilvanya’nın merkezindeki iki arıtma tesisinden haftada iki kez toplanan ham kanalizasyon örneklerini tifo dışı Salmonella açısından test ettiler ve izolatları tüm genom dizilimi kullanarak karakterize ettiler. Atık su örneklerinden 43 Salmonella izolatı elde ettiler ve bunları genomik analizle yedi serovara ayırdılar; bunlar benzerliklere dayalı mikroorganizma gruplarıdır. İzolatların sekizi veya yaklaşık yüzde 20’si, Baildon adı verilen nadir bir Salmonella türündendi.
Araştırmacılar, atık sudan izole edilen tifo dışı Salmonella izolatları ile salmonellozlu hastalardan alınan benzer bakteriler arasındaki genetik ilişkiyi ve epidemiyolojik bağlantıları değerlendirdiler. Atık sudan izole edilen Salmonella Baildon serovarları, aynı dönemde bölgede salmonelloz salgınıyla ilişkili bir hastada bulunan benzer bir bakteriden genetik olarak ayırt edilemedi. Atık sudan izole edilen Salmonella Baildon ve ulusal salgın tespit veritabanındaki salgınla ilişkili 42 izolat aynı genetik yapıya sahipti. 42 salgınla ilişkili izolattan biri, yaklaşık 17.000 kişiye hizmet veren atık su çalışması örnek toplama havzasında ikamet eden bir hastadan elde edildi.